Pobudnica ločitve zvezdniškega para je bila vedno podrejena in tiha Katie Holmes. Po petih letih zakona je igralka brez vednosti moža vložila prošnjo na enem od newyorških sodišč. Uradni razlog so "nezdružljive razlike". V isti izjavi je Katie sodišče prosila, naj ji dodeli pravno podporo od bivšega moža in plačilo preživnine za otroka. Par je kasneje podpisal sporazum glede pogojev ločitve.
Vzgoja hčere je eden glavnih razlogov za ločitev Katie Holmes in Toma Cruisea. Igralka ni bila zadovoljna, da je Tom sprejel vse pomembne odločitve v življenju njune skupne 6-letne Suri. Ljubeč 49-letni oče je otroku v vsem privoščil otrokove muhe in želje, medtem ko se je o načinih vzgoje pozabil posvetovati z ženo.
Cathy ni bilo všeč, da je bil dojenček namerno uveden v scientologijo, versko doktrino, katere Tom je postal goreč zagovornik. Poleg tega so tabloidi celo odkrili, da je Cruz dosegel skoraj najvišjo raven v učenjih Rona Hubbarda. Katie tako ali drugače ni nikoli podpirala moža pri njegovem hobiju, na predvečer poroke pa se je odrekla katolištvu zgolj zaradi ljubezni do moža.
Zaradi zaskrbljenosti zaradi negativnega vpliva verskih pogledov Toma Cruisea na dekle je Holmes poskušal doseči popolno in edino skrbništvo nad njuno skupno hčerko. Z vzgojo se namerava ukvarjati tudi sama. Zato je v New Yorku vložila zahtevo za ločitev - v tej državi sodišča večinoma odločajo v korist enega od staršev.
Vendar pa je čez nekaj časa zvezdniški par prišel do podpisa vzajemno zadovoljivih pogojev. Deklica ostane pri materi, živela bo v New Yorku, hodila v katoliško šolo, oče pa bo imel pravico do srečanja z otrokom. Tom je dolžan tudi hčerki pokriti znatne stroške, plačati preživnino za otroke (znesek ni objavljen, na primer celotna garderoba deklice je že ocenjena na tri milijone dolarjev).
Postalo je znano, da namerava Katie Holmes v bližnji prihodnosti spremeniti ime svoje hčerke v Scout Holmes. Izjavila je, da ji ime Suri nikoli ni bilo všeč, in hčerki Scout reče ime junakinje svoje najljubše knjige To Kill a Mockingbird. Vendar bo priimek Cruz prepustila otroku, a le kot znak, da je njen oče.
Preostali pogoji za ločitev so bili jasno zapisani v zakonski pogodbi, zato delitve premoženja po sodišču ne bo. Torej, v skladu s pravnim dokumentom, ki sta ga pred poroko prostovoljno podpisala, bi morala Katie Holmes prejeti 3 milijone dolarjev za vsako leto poroke in dvorec v Kaliforniji v vrednosti 35 milijonov dolarjev (če bi par trajal več kot 11 let zakona, bi Katie lahko zahtevati polovico lastnine). Hkrati je splošno premoženje zakoncev danes ocenjeno na 275 milijonov dolarjev. Mimogrede, Tom je na poroki, ki je potekala v skladu s scientološkimi kanoni, dal tradicionalno prisego in obljubil, da bo v primeru ločitve Katie zagotovil le "ponev, glavnik in mačka."
